Recently Published
Evaluation of Some Specific Primer Sets Development for Detecting Fusarium Oxysporum F. SP. Cubense Tropic Race 4 (Foc TR4) Originating From Indonesia Image
Journal article

Evaluation of Some Specific Primer Sets Development for Detecting Fusarium Oxysporum F. SP. Cubense Tropic Race 4 (Foc TR4) Originating From Indonesia

Identification of the Causal Agent of Cocoa Pod Rot Disease From Various Locations Image
Identification of the Causal Agent of Cocoa Pod Rot Disease From Various Locations Image

Identification of the Causal Agent of Cocoa Pod Rot Disease From Various Locations

The Role of Turnera Subulata and Cosmos Sulphureus Flowers in the Life of Anagrus Nilaparvatae (Hymenoptera: Mymaridae) Image
The Role of Turnera Subulata and Cosmos Sulphureus Flowers in the Life of Anagrus Nilaparvatae (Hymenoptera: Mymaridae) Image

The Role of Turnera Subulata and Cosmos Sulphureus Flowers in the Life of Anagrus Nilaparvatae (Hymenoptera: Mymaridae)

Most Viewed
Optimasi Metode PCR untuk Deteksi Pectobacterium Carotovorum, Penyebab Penyakit Busuk Lunak Anggrek Image
Journal article

Optimasi Metode PCR untuk Deteksi Pectobacterium Carotovorum, Penyebab Penyakit Busuk Lunak Anggrek

Soft rot is one of the most important diseases of orchids caused by Pectobacterium carotovorum. The conventional methods for the detection of pathogen is tedious and time consuming. In recent years, numerous molecular diagnostic approaches for the detection of P. carotovorum have been developed, including various PCR-based assays. Optimization of PCR technique to DNA amplification is essential for time and material efficiency, which will make detection to be rapid and more appropriate. The purposes of this study were to decide concentration of DNA and primer, and also the concentration of bacterial pure cultures and primer to amplify 16S rRNA gene fragment. Optimization of PCR was done by using various concentration of DNA, pure cultures of bacteria, and primer to amplify the 16S rRNA gene sequence. The results showed that the most optimum concentration to amplify 16S rRNA gene sequence at DNA and primer concentration were 63,4 ng/µl and 10 pmol, while pure cultures and primer concentrations were at 8×109 CF U/ml and 10 pmol respectively. Penyakit busuk lunak yang disebabkan oleh Pectobacterium carotovorum merupakan salah satu penyakit penting pada tanaman anggrek. Deteksi patogen secara cepat dan akurat dapat dilakukan secara molekular menggunakan teknik Polymerase chain reaction (PCR). Optimasi metode PCR perlu dilakukan untuk mengefisienkan waktu dan penggunaan bahan sehingga proses deteksi dapat dilakukan dengan cepat dan tepat. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan konsentrasi DNA dengan primer maupun konsentrasi kultur murni bakteri dengan primer yang paling tepat untuk mendapatkan fragmen gen 16S rRNA. Optimasi PCR dilakukan menggunakan beberapa variasi pengenceran pada DNA, kultur murni bakteri, dan primer untuk mengamplifikasi gen 16S rRNA. Hasil penelitian menunjukkan bahwa konsentrasi yang paling optimal untuk mengamplifikasi gen 16S rRNA yaitu DNA dan primer masing-masing sebesar 63,4 ng/µl dan 10 pmol, sedangkan konsentrasi kultur murni dan primer sebesar 8×109 CFU/ml dan 10 pmol.
Identifikasi Morfologi Beberapa Spesies Jamur Fusarium Image
Journal article

Identifikasi Morfologi Beberapa Spesies Jamur Fusarium

The research was conducted to study the morphological difference based on macroscopic and microscopic appearance of several Fusarium spp. Fusarium spp. isolates were propagated onto Potato Dextrose Agar (PDA) by using single-spore method. All isolates were observed macroscopically and microscopically to determine colony appearance, colony growth diameter and formation of macroconidia, microconidia and conidiophores. The results showed that colony appearance of all isolates was similar. Therefore they could not clearly be differentiated by one to another. On the other hand, microscopic observation showed that there was different conidiophore morphology of F. oxysporum and other Fusarium spp. Microscopic morphology among F. oxysporum isolates were difficult to differentiate. Microconidia were produced in false-head which was the characteristic feature of most F. oxysporum. In conclusion, microscopic morphology observation could only be able to differentiate Fusarium spp. isolates at species level, but not to formae speciales. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui perbedaan morfologi berdasarkan morfologi makroskopis dan mikroskopis beberapa isolat Fusarium spp. Isolat Fusarium spp. diperbanyak pada medium Potato Dextrose Agar (PDA) dengan menggunakan teknik monospora. Semua isolat ini kemudian diamati secara makroskopis dan mikroskopis untuk mengetahui morfologi koloni, pertumbuhan koloni, bentuk makrokonidium dan mikrokonidium serta konidiofornya. Hasil penelitian menunjukkan bahwa sebagian besar isolat mempunyai morfologi koloni yang hampir sama, sehingga tidak bisa dibedakan dengan jelas satu dengan lainnya. Akan tetapi, pengamatan secara mikroskopis menunjukkan adanya perbedaan morfologi konidiofor pada isolat F. oxysporum dengan Fusarium spp., sementara morfologi mikroskopis antara isolat Fusarium spp. sulit untuk dibedakan. Mikrokonidium yang dibentuk pada false-head merupakan karakter utama F. oxysporum. Dari hasil penelitian ini dapat disimpulkan bahwa morfologi mikroskopis hanya dapat digunakan untuk membedakan Fusarium spp pada tingkat spesies, tetapi tidak pada tingkat forma spesialis.
Ketahanan Jamur terhadap Fungisida di Indonesia Image
Journal article

Ketahanan Jamur terhadap Fungisida di Indonesia

Identifikasi Penyebab Penyakit Daun Keriting Kuning Pada Tanaman Mentimun Image
Journal article

Identifikasi Penyebab Penyakit Daun Keriting Kuning Pada Tanaman Mentimun

Biological Control of Plant Disease Caused by Bacteria Image
Journal article

Biological Control of Plant Disease Caused by Bacteria

Identifikasi Molekuler Virus Penyebab Penyakit Daun Keriting Isolat Bantul pada Melon Image
Journal article

Identifikasi Molekuler Virus Penyebab Penyakit Daun Keriting Isolat Bantul pada Melon

Ketahanan Jamur terhadap Fungisida di Indonesia Image
Ketahanan Jamur terhadap Fungisida di Indonesia Image
Journal article

Ketahanan Jamur terhadap Fungisida di Indonesia

Identifikasi Penyebab Penyakit Daun Keriting Kuning Pada Tanaman Mentimun Image
Identifikasi Penyebab Penyakit Daun Keriting Kuning Pada Tanaman Mentimun Image
Journal article

Identifikasi Penyebab Penyakit Daun Keriting Kuning Pada Tanaman Mentimun

Identifikasi Molekuler Virus Penyebab Penyakit Daun Keriting Isolat Bantul pada Melon Image
Identifikasi Molekuler Virus Penyebab Penyakit Daun Keriting Isolat Bantul pada Melon Image
Journal article

Identifikasi Molekuler Virus Penyebab Penyakit Daun Keriting Isolat Bantul pada Melon

Suggested For You
Survei Odontoglossum Ringspot Virus (ORSV) yang Menginfeksi Anggrek Alam Tropis di Indonesia Image
Journal article

Survei Odontoglossum Ringspot Virus (ORSV) yang Menginfeksi Anggrek Alam Tropis di Indonesia

Natural orchids are one of the important ornamental plants that were cultivated in tropical countries, including Indonesia. Virus infections has been important limiting factor in orchids cultivation because it decreases the orchids quality. Odontoglossum ringspot virus (ORSV) is one of the most reported virus infecting orchids which spread widely in the world. During 2010–2014 surveys of viral infections were conducted in Indonesia. The orchids were found infected by virus, showed symptoms of mosaic, mottle, chlorotic, necrotic, streak, wilting leaf, and ringspot on leaf surface. Detection with serological test DAS-ELISA showed only 11 from 125 samples were infected by ORSV with total incidence of 8,8%. Nine leaf samples of Phalaenopsis sp. were infected, respectively. Thus, it was concluded that Phalaenopsis is orchids genus which is the most abundantly and susceptibly infected by ORSV. The results proved that ORSV have entered and spread widely by infected orchids in orchids landscape (nursery), semi-natural forests (botanical gardens), and natural forest (national park) throughout Indonesia. This is the first report of ORSV infecting natural tropical orchids in Indonesia. INTISARI Anggrek alam merupakan salah satu kekayaan flora asli negara tropis, termasuk Indonesia. Keberadaan di habitat aslinya sudah sangat berkurang yang disebabkan kerusakan hutan dan adanya penyakit. Infeksi virus masih menjadi faktor pembatas terpenting dalam budidaya dan pengembangan potensi anggrek alam. Odontoglossum ringspot virus (ORSV) adalah salah satu jenis virus yang dilaporkan paling banyak menginfeksi anggrek serta memiliki penyebaran yang luas di dunia. Selama 2010-2014 telah dilakukan survei lapangan terhadap infeksi virus di Indonesia. Beberapa anggrek yang ditemukan terinfeksi oleh virus menunjukkan gejala berupa mosaik, belang, klorosis, nekrosis, streak, daun layu, dan bercak cincin pada permukaan daun. Deteksi dengan uji serologis DAS-ELISA menunjukkan bahwa 11 dari 125 sampel terinfeksi oleh ORSV dengan total kejadian 8,8%. Masing-masing sembilan dari total sampel daun terinfeksi merupakan Phalaenopsis sp. Hal ini menjelaskan bahwa Phalaenopsis adalah genus anggrek yang paling cocok dan rentan terhadap infeksi ORSV. Hasil penelitian survei kejadian infeksi Odontoglossum ringspot virus (ORSV) membuktikan bahwa virus ini telah masuk dan menyebar secara luas oleh anggrek-anggrek alam tropis yang terinfeksi di pertamanan anggrek (nurseri), hutan semi-alami (kebun raya), dan hutan alam (taman nasional) di seluruh wilayah Indonesia. Ini merupakan laporan pertama mengenai infeksi ORSV terhadap anggrek-anggrek alam tropis di Indonesia.
Potensi Bakteri Endofit Dalam Menekan Penyakit Layu Stewart (Pantoea Stewartii Subsp. Stewartii) Pada Tanaman Jagung Image
Journal article

Potensi Bakteri Endofit Dalam Menekan Penyakit Layu Stewart (Pantoea Stewartii Subsp. Stewartii) Pada Tanaman Jagung

Metode Isolasi Pyricularia Oryzae Penyebab Penyakit Blas Padi Image
Journal article

Metode Isolasi Pyricularia Oryzae Penyebab Penyakit Blas Padi

Penggunaan Protozoa Sarcocystis Singaporensis (Apicomplexa: Sarcocystidae) Untuk Pengendalian Tikus Sawah Rattus Argentiventer Image
Journal article

Penggunaan Protozoa Sarcocystis Singaporensis (Apicomplexa: Sarcocystidae) Untuk Pengendalian Tikus Sawah Rattus Argentiventer

Potensi Bakteri Endofit Dalam Menekan Penyakit Layu Stewart (Pantoea Stewartii Subsp. Stewartii) Pada Tanaman Jagung Image
Potensi Bakteri Endofit Dalam Menekan Penyakit Layu Stewart (Pantoea Stewartii Subsp. Stewartii) Pada Tanaman Jagung Image
Journal article

Potensi Bakteri Endofit Dalam Menekan Penyakit Layu Stewart (Pantoea Stewartii Subsp. Stewartii) Pada Tanaman Jagung

Metode Isolasi Pyricularia Oryzae Penyebab Penyakit Blas Padi Image
Metode Isolasi Pyricularia Oryzae Penyebab Penyakit Blas Padi Image
Journal article

Metode Isolasi Pyricularia Oryzae Penyebab Penyakit Blas Padi

Penggunaan Protozoa Sarcocystis Singaporensis (Apicomplexa: Sarcocystidae) Untuk Pengendalian Tikus Sawah Rattus Argentiventer Image
Penggunaan Protozoa Sarcocystis Singaporensis (Apicomplexa: Sarcocystidae) Untuk Pengendalian Tikus Sawah Rattus Argentiventer Image
Journal article

Penggunaan Protozoa Sarcocystis Singaporensis (Apicomplexa: Sarcocystidae) Untuk Pengendalian Tikus Sawah Rattus Argentiventer

Read more articles